WSUSにはクリーンアップという機能があります。これを長時間放置しているとちょっとめんどくさいことになったので備忘録として残しておきます。
クリーンアップを実行してみると

ここで動かなくなった、、、ついでにWSUSも動作が不安定になった、、、
どうやらWSUSクリーンアップがタイムアウトしているっぽいとのこと
困っていたらMicrosoftのWSUSサポートチームの方の記事を見つけました
https://jpmem.github.io/blog/wsus/2018-02-05_01
とりあえずインデックスの再構成というものをしてクリーンアップを終わるまで繰り返しするということでした。
WSUSがダウンしても、タイムアウトしてもとりあえず再起動しつつ繰り返しやるということです(根性)
そしてPowershellも駆使しつつ繰り返しやってみると、、、

なんか終わった気配が!?

ウィザードでもタイムアウトになっていた問題の部分をパスできてます!
その後クリーンアップが正常終了したという画面が出ました!
とりあえず根性で繰り返しやり続けるっていうことでした。

